芸術研究所では、芸術の科学的研究機関として多彩なプロジェクトに取り組んでいます。たとえば学科を超えた研究・教育・創作活動の成果を、学内外に広く発信することを目的としたＮＡＰ（日藝アートプロジェクト事業）や、文部科学省私立大学学術研究高度化推進事業のうちのオープン・リサーチ・センター整備事業に採択された「日本舞踊の教育システムの文理離融合型基盤研究並びにアジアの伝統舞踊との比較研究」など、芸術総合学部の特性を生かした活動を進めています。
研究教育・情報センターは、大学院・学部の研究・創作・教育活動を支援し、その促進に寄与することを目的として、芸術関連情報を集約し、情報の受信・発信基地としての機能を有するとともに、個人研究及び共同研究等の支援を行っています。また、同センターは各種シンポジウムの支援、国内外から受け入れた客員研究員との研究交流、IT分野における最新技術の研修会開催等、高等教育研究機関の拠点として活動しています。
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文部科学省のオープン・リサーチ・センター整備事業（ORC）の一環として行われている「NANA」は、日本舞踊の教育システムの文理融合型の基盤研究を中心に、アジアの伝統舞踊との比較研究をすることによって、それらの発展と交流をめざすプロジェクトです。「NANA」という名称は、日本大学芸術学部（NU Art）、日本舞踊とアジアの伝統舞踊（Nichibu & Asian dance）の頭文字をとっています。
芸術学部が行うこの事業は、「総合的な文化・情報の学科横断的な研究・教育・創作活動の成果を、学外との連携を図りつつ、学内外に広く発信することを目的とする」ものです。専任教員の指導のもと、日藝の学部生や院生が参加し、また学外の方も加わり、総合的な研究や制作を行っています。NAPでは、これまでに演劇上演や博物館の企画、アートによる自然環境・地域再生、練馬区独立60周年記念提携事業のプロジェクトなどを行ってきました。
